复旦大学图书馆是中国高校图书情报工作指导委员会副主任委员馆，是CASHL（中国高校人文社会科学文献中心）的两个全国中心馆之一。设有教育部面向全国和华东地区的外国教材中心，教育部文科外文图书引进中心书库、欧盟图书专架、教育部科技查新工作站（综合类）、上海市科委科技查新站（计算机与生物）、全国医学文献检索教学研究会理事长馆兼秘书处、图书馆学硕士培养点、中国索引学会秘书处，并承担了《中国索引》杂志的编辑出版工作。
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